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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

进口年宵花“走红”东莞年货市场******

　　(新春走基层)进口年宵花“走红”东莞年货市场

　　中新网东莞1月12日电 (唐贵江 杨园园)春节临近，蝴蝶兰、朱顶红、郁金香等年宵花品种持续热销，东莞花卉市场进入销售旺季。

　　年宵花代表着人们对新一年美好的期盼，适合装点新年的喜庆气氛，而许多进口高端花卉品种，更是凭借着品质高、富有新鲜感等优势，受到众多消费者的青睐。

　　位于东莞市的广东圣茵花卉园艺有限公司自去年9月份开始从荷兰、以色列等地进口朱顶红等花卉，备货年货市场。“朱顶红花色艳丽、花朵硕大，是年货市场上比较受欢迎的进口花卉。在海关的指导和帮助下，我们已经进口了超过30万株，销往全国各地，为年货市场带去一抹喜气。我也借着这有美好寓意的花朵，祝大家新的一年日子越过越红火！”广东圣茵花卉园艺有限公司董事长周世明满脸笑意地说。

　　为助力当地国际花卉产业健康发展，黄埔海关所属东莞海关充分发挥职能作用，加大对进口种苗花卉产品各个环节的监管力度。

　　“通关时效直接关系到进口花卉的存活率。”东莞海关查验科副科长李光伟介绍说，“我们指导企业充分运用‘提前申报’‘两步申报’‘两段准入’等便利化措施，同时开辟花卉产品进口‘绿色通道’，做到即报即检。下一步我们将对符合要求的进口花卉实施附条件提离措施，既保障进口花卉质量安全，又提高通关速度保障了通关效率。”

　　“在海关的指导下，我们正在办理相关手续，附条件提离可以缩短我们的检测等待时间约7-10天，这可以大幅节省我们的仓储费用，降低通关成本。”周世明说。

　　“接下来，我们将扩大引进优质种苗，培育更具有市场竞争力的品种，相信我们的年宵花可以红遍大江南北！”周世明对年宵花的销售前景满怀期待。(完)

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）